En Clank! En el espacio entran en juego las facciones, que otorgan bonificaciones cuando se juegan cartas del mismo tipo. Otra diferencia con el Clank! clásico es que puedes usar teletransportadores o ascensores dentro de la nave, cosa que facilita enormemente el movimiento. Sin embargo, para acceder al lugar donde se encuentran los artefactos primero será necesario hackear un puerto de datos, cosa que enfurecerá a Lord Eradikus.